Tropopoiitiko Fek

Research Team 5

Title: «Study of bioactive natural compounds with pharmacological interest in pathophysiological conditions associated with angiogenesis and inflammation»

Supervisor: Loutrari Eleni, Μοριακή Βιολόγος PhD 

Άμεσοι Επιστημονικοί Συνεργάτες:

Michailidou Mary, MSc, PhD, μεταδιδακτορική ερευνήτρια

Ιωάννα Νάκα, προπτυχιακή φοιτήτρια Σχολής Χημικών Μηχανικών ΕΜΠ σε διπλωματική ερευνητική εργασία

 

Ερευνητικές δραστηριότητες

Τα ερευνητικά ενδιαφέροντα της ομάδας μας επικεντρώνονται κυρίως στη μελέτη της διαδικασίας της παθοφυσιολογικής αγγειογένεσης και την ανάδειξη ενώσεων βιοϊατρικού ενδιαφέροντος με πιθανή χημειοπροστατευτική ή θεραπευτική δράση σε προκλινικά μοντέλα αγγειογένεσης που σχετίζονται με παθολογικές καταστάσεις (καρκίνος, φλεγμονή, ισχαιμία).

Ιδιαιτέρως ασχολούμαστε με τον έλεγχο βιοδραστικών φυσικών ενώσεων ή συνθετικών αναλόγων τους με πιθανά βελτιωμένες βιολογικές ή φαρμακοκινητικές ιδιότητες και την ενδελεχή μελέτη των μηχανισμών δράσης τους στα κύτταρα-στόχους. Συγκεκριμένα μελετώνται οι μεταβολές που προκαλούν οι εξεταζόμενες ενώσεις σε επίπεδο κυτταρικών λειτουργιών, σηματοδοτικών μονοπατιών, γονιδιακής έκφρασης αλλά και μεταβολικών δικτύων. Για το σκοπό αυτό η ομάδα μας χρησιμοποιεί σύγχρονες μεθοδολογίες κυτταρικής και μοριακής βιολογίας, αναπτύσσει in vitro και in vivo πειραματικά μοντέλα και συνδυάζει τεχνολογίες υψηλής απόδοσης (high-throughput) με προσεγγίσεις Συστημικής Βιολογίας (transcriptomics, functional/signaling proteomics, metabolomics).

 Αναλυτικότερα  σε εξέλιξη βρίσκονται οι ακόλουθες ερευνητικές μελέτες:

  1. Ανάπτυξη νέων φαρμακευτικών προϊόντων ρυθμιστών της αγγειογένεσης μέσω της αξιολόγησης μιας εκτενούς βιβλιοθήκης εκχυλισμάτων από φυτά της ελληνικής χλωρίδας, μεμονωμένων συστατικών τους ή συνθετικών αναλόγων τους.
  2. Προσδιορισμός φυσικών αναστολέων ανθρώπινων ηπατοκυτταρικών καρκινωμάτων μέσω συστημικής βιολογικής προσέγγισης.
  3. Ανάλυση της δράσης του μαστιχελαίου απο το φυτό Pistacia lentiscus variation chia στη γονιδιακή έκφραση ανθρώπινων κυττάρων Κ562 λεμφοβλαστώματος, Α549 καρκινώματος πνεύμονα και HCT116 καρκινώματος παχέως εντέρου.
  4. Μελέτη της πιθανής θεραπευτικής δράσης της πολυφαινόλης epigallocatechin-3-gallate από το πράσινο τσάι στο πειραματικό μοντέλο της ανοσοσολογικά επαγόμενης σπειραματονεφρίτιδας.

Συνεργασίες

Στις μελέτες μας συνεργαζόμαστε τόσο με άλλες ομάδες στα Ερευνητικά Εγαστήρια «Γ.Π. Λιβανός και Μ. Σίμου» (Υπεύθυνοι Καθηγητές κ.Λιανός, κ. Παπαπετρόπουλος, κ. Κοτανίδου)  όσο και με ομάδες σε άλλους φορείς όπως: το Εργαστήριο Φαρμακογνωσίας και Χημείας Φυσικών Προϊόντων της Φαρμακευτικής Σχολής του ΕΚΠΑ (Καθ. κ Σκαλτσούνης), το Εργαστήριο Βιοτεχνολογίας της Σχολής Χημικών Μηχανικών του ΕΜΠ (Καθ. κ. Κολίσης), το Εργαστήριο Συστημικής Βιολογίας και Βιομηχανικής της Σχολής Μηχανολόγων Μηχανικών του ΕΜΠ (Επικ. Καθ. κ. Αλεξόπουλος), το Πρόγραμμα Μεταβολικής Μηχανικής και Βιοπληροφορικής του Ινστιτούτου Βιολογίας, Φαρμακευτικής Χημείας και Βιοτεχνολογίας στο Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών (Δρ. Χατζηιωάννου, Ερευνητής Β’).


ΤΕΧΝΟΓΝΩΣΙΑ ΟΜΑΔΑΣ 

 

ΚΥΤΤΑΡΟΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΕΣ

  • Απομόνωση και καλλιέργεια πρωτογενών ενδοθηλιακών κυττάρων, καλλιέργεια κυτταρικών σειρών (καρκινικά κύτταρα, μετασχηματισμένοι ινοβλάστες κλπ).
  • Ανάπτυξη-εφαρμογή πολλαπλών κυτταρικών δοκιμών (κυτταρικός πολλαπλασιασμός, κυτταροτοξικότητα, απόπτωση, μετανάστευση, διήθηση, διαφοροποίηση, κλπ)
  • Μικροβιακές καλλιέργειες
  • Εφαρμογή μεθόδων ανοσοφθορισμού

 

ΜΟΡΙΑΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ

  • Σταθερή ή παροδική έκφραση εξωγενών γονιδίων σε ευκαρυωτικά κύτταρα μετά από μετασχηματισμό τους με ανασυνδυασμένα πλασμίδια-φορείς.
  • Παραγωγή και χρήση αδενοϊών για την έκφραση γονιδίων.
  • Τεχνικές μοριακής κλωνοποίησης και υποκλωνοποίησηςDNA.
  • In vitro μεταγραφή και μετάφραση κλωνοποιημένων γονιδίων.
  • Aπομόνωση-ανάλυση ολικού RNA ευκαρυωτικών κυττάρων
  • In  vitro ενίσχυσηDNA με την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) καθώς και Real-time PCR.

ΣΥΣΤΗΜΙΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ-ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΥΨΗΛΗΣ ΑΠΟΔΟΣΗΣ

  • Ανάλυση γονιδιακής έκφρασης με μικροσυστοιχίες DNA(genomics)
  • Ανάλυση κυτταρικής απάντησης σε επίπεδο σηματοδοτικών φωσφωπρωτεϊνών (φωσφοπρωτεομική) και εκκρινόμενων παραγόντων (π.χ. κυταροκινών) με σύστημα Luminex (proteomics).
  • Μελέτη κυτταρικού κύκλου, κυτταρικού θανάτου, κατακερματισμόςDNA, ανίχνευση δεικτών αιμοποιητικών κυττάρων (CD markers) με Κυτταρομετρία ροής (FACS)

ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ-ΑΝΟΣΟΧΗΜΕΙΑ

  • Ηλεκτροφόρηση πρωτεϊνών σε πηκτώματα πολυακρυλαμιδίου (SDS-PAGE)-Ανίχνευση με τη μέθοδο της ανοσοαποτύπωσης (Western blotting)
  • ELISA
  • Μεταβολική σήμανση κυτταρικών αντιγόνων και ανοσοκατακρήμνιση
  • Καθαρισμός βιολογικών μορίων με χρωματογραφικές μεθόδους (FPLC, HPLC).
  • Ανοσοϊστοχημεία

 

ΑΝΑΠΤΥΞΗ-ΕΦΑΡΜΟΓΗ IN VIVO ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΩΝ ΜΟΝΤΕΛΩΝ

 

  • Μοντέλα ανάπτυξης διαφόρων τύπων καρκίνου σε πειραματόζωα.
  • Μοντέλα αγγειογένεσης σε πειραματόζωα και σε χοριοαλλαντοϊκή μεμβράνη κοτόπουλου